隨著幽靈少女的本體正式加入，一○六號房的人口密度也跟著直線攀升。在一片和樂融融的氣氛之中，唯獨由莉佳眉頭深鎖。之前的事件結束之後，由莉佳不知道該如何面對孝太郎，兩人的關係陷入了尷尬的局面。這時受傷引退的前任Dark Navy真那突然出現在真希的面前，黑暗的魔法少女即將展開行動！